微囊藻毒素是一类具有生物活性的七肽单环肝毒素。由于多肽中两种可变氨基酸组成的不同，具有多种异构体。其中存在最普遍、含量最多的是微囊藻毒素LR，微囊藻毒素RR，微囊藻毒素YR这3种微囊藻毒素(L、R、Y分别代表亮氨酸、精氨酸和酪氨酸)。具有水溶性和耐热性，加热煮沸都不能将毒素破坏；自来水处理工艺的混凝沉淀、过滤、加氯、氧化、活性炭吸附等也不能将其完全去除。易溶于水、甲醇或丙酮，不挥发，抗pH变化，化学性质相当稳定，自然降解过程十分缓慢。世界卫生组织(WHO)推荐的饮水中的藻毒素标准为1.0μg/L，《生活饮用水卫生标准》(GB5749—2006)将饮用水中微囊藻毒素含量限制为1.0μg/L。水中微囊藻毒素可采用高效液相色谱法和间接竞争酶联免疫吸附法测定。